DeepMind 發布 AlphaGenome 2,一款可預測特定細胞類型中變異影響的 DNA 模型
Google DeepMind 宣布推出 AlphaGenome 2,這是一款新一代 DNA 序列模型,可預測 DNA 序列及其變異如何影響特定的人類細胞類型。該條件模型基於 68 種組織中超過 1.07 億個單細胞圖譜訓練,識別出的改變表現的變異數量幾乎是前代模型的兩倍;在 TenK10K 免疫細胞資料集上,它找回了 30% 的因果變異,而原始 AlphaGenome 在單細胞資料上微調後僅找回 16%。該模型可透過 AlphaGenome API 供非商業研究使用,商業研究則可透過私人預覽取得。
推薦理由:AlphaGenome 2 從大量組織平均值轉向單細胞條件化,在免疫細胞資料上將因果變異召回率大致提高了一倍,這對於將 GWAS 訊號連結到特定細胞類型具有重要意義。