DeepMind phát hành AlphaGenome 2, mô hình DNA dự đoán tác động của biến thể trong từng loại tế bào cụ thể
AlphaGenome 2: Deciphering how cells read DNA to better understand disease
Google DeepMind công bố AlphaGenome 2, mô hình chuỗi DNA thế hệ mới dự đoán cách các chuỗi DNA và biến thể của chúng ảnh hưởng đến các loại tế bào người cụ thể. Được huấn luyện trên hơn 107 triệu hồ sơ tế bào riêng lẻ thuộc 68 mô, mô hình có điều kiện này xác định được gần gấp đôi số biến thể làm thay đổi biểu hiện so với mô hình trước đó, và trên bộ dữ liệu tế bào miễn dịch TenK10K, nó thu hồi được 30% biến thể nhân quả so với 16% của AlphaGenome gốc được tinh chỉnh trên dữ liệu đơn bào. Mô hình có sẵn cho nghiên cứu phi thương mại qua AlphaGenome API và ở chế độ xem trước riêng tư cho nghiên cứu thương mại.
AlphaGenome 2 chuyển từ giá trị trung bình trên toàn mô sang điều kiện hóa theo từng tế bào, gần như tăng gấp đôi khả năng thu hồi biến thể nhân quả trên dữ liệu tế bào miễn dịch, điều này quan trọng để liên kết tín hiệu GWAS với các loại tế bào cụ thể.
Nguồn:Google DeepMind · deepmind.google