DeepMind เปิดตัว AlphaGenome 2 โมเดล DNA ที่ทำนายผลของตัวแปรในเซลล์ชนิดเฉพาะ
AlphaGenome 2: Deciphering how cells read DNA to better understand disease
Google DeepMind ประกาศเปิดตัว AlphaGenome 2 โมเดลลำดับ DNA รุ่นใหม่ที่ทำนายว่าลำดับ DNA และตัวแปรของลำดับนั้นส่งผลต่อเซลล์มนุษย์ชนิดเฉพาะอย่างไร โมเดลแบบมีเงื่อนไขนี้ฝึกจากโปรไฟล์เซลล์แต่ละเซลล์มากกว่า 107 ล้านโปรไฟล์จาก 68 เนื้อเยื่อ สามารถระบุตัวแปรที่เปลี่ยนการแสดงออกได้เกือบสองเท่าของโมเดลก่อนหน้า และบนชุดข้อมูลเซลล์ภูมิคุ้มกัน TenK10K สามารถเรียกคืนตัวแปรเชิงสาเหตุได้ 30% เทียบกับ 16% ของ AlphaGenome เดิมที่ปรับแต่งบนข้อมูลเซลล์เดี่ยว ใช้งานได้สำหรับการวิจัยที่ไม่ใช่เชิงพาณิชย์ผ่าน AlphaGenome API และอยู่ในช่วงพรีวิวแบบส่วนตัวสำหรับการวิจัยเชิงพาณิชย์
AlphaGenome 2 เปลี่ยนจากค่าเฉลี่ยระดับเนื้อเยื่อไปสู่การปรับเงื่อนไขระดับเซลล์เดี่ยว ทำให้การเรียกคืนตัวแปรเชิงสาเหตุบนข้อมูลเซลล์ภูมิคุ้มกันเพิ่มขึ้นราวสองเท่า ซึ่งสำคัญต่อการเชื่อมสัญญาณ GWAS เข้ากับเซลล์ชนิดเฉพาะ
แหล่งข่าว:Google DeepMind · deepmind.google